Если у вашего сына есть отсрочка, в отношении него не имеют права проводить медосвидетельствование до ее окончания (если только ваш сын не подписал письменной разрешение на его проведение). Вы можете подать жалобу в военную прокуратуру с просьбой признать проведенное медосвидетельствование незаконным, а его результаты недействительными. Перед новой медкомиссией вам нужно приобщить заверенные копии медицинских документов, подтверждающих наличие диагнозов, к личному делу призывника. 
Если у него есть повестка на медосвидетельствование 06.06.23 (зачем ему назначили еще одно, если он его уже прошел?), а он к этому времени еще будет числиться студентом колледжа с отсрочкой, то вы можете обжаловать данную повестку в военную прокуратуру.

Вы все еще можете подать заявление на АГС.