В военкомате не ставят диагнозы, там проводят медосвидетельствование - визуальный осмотр и проверку медицинских документов. Предоставить медицинские документы, подтверждающие наличие проблем со здоровьем, - ваша задача. Если вы не согласны с решением призывной комиссии о категории годности, то это решение нужно обжаловать в вышестоящий военкомат или в суд.
Если же призывной комиссии еще не было и вы недовольны действиями врача в военкомате, либо его решением, то обжаловать его действия нужно:
1. в призывную комиссию, а если не сработает - в вышестоящую призывную комиссию
2. в органы медицинского надзора и контроля.
Также жаловаться можно в суд